Esta unidad se desempeña de manera transversal entre diferentes servicios dentro del Hospital Regional Coyhaique, además de trabajar con otros establecimientos de la red y la Seremi de Salud.
El principal objetivo de la Unidad de Epidemiología del Hospital Regional Coyhaique es vigilar eventos de salud pública tanto a nivel local, nacional o internacional, que puedan afectar a la comunidad, utilizando esta información como insumo para elaborar informes y brindársela a los equipos de salud.